Molecular Modelling

Überblick der Anwendungen

Aktualisierung der Seiten auf Jmol/JSmol: U. Leisinger

Tutorial: Antikörper - Meister der molekularen Erkennung

(R. Deuber) neu Jmol/JSmol
Das Tutorial beantortet Fragen nach dem strukturellen Aufbau eines Antikörpers für die Mobilisierung der Immunantwort; nach Art der Kräfte für die Antigen-Erkennung; nach der riesigen Vielfalt von Antikörpern; sowie zur Unterscheidung zwischen Selbst und Nicht-Selbst


Molekularium

(U. Leisinger) Jmol/JSmol
Atomorbitale, Molekülorbitale, Schwingungsmodi, Energiediagramme, Strahlungsübergänge, Kristallstrukturen, zwischenmolekulare Wechselwirkungen und mehr. Weitere Jmol-Seiten zu ähnlichen Themen



Substratspezifität von Trypsin und Chymotrypsin

(R. Deuber) neu: Jmol/JSmol
Die beiden Verdauungsenzyme Trypsin und Chymotrypsin sind in ihrer Struktur und Funktion sehr ähnlich, spalten Proteine aber bei unterschiedlichen Aminosäuren. Die molekularen Hintergründe zeigen sich in der dreidimensionalen Darstellung.

Zur Anwendung "Substratspezifität von Trypsin und Chymotrypsin" gibt es auch ein Praktikum, mit dem Schüler/innen auf einfache Weise die Substratspezifität im Labor experimentell untersuchen können.
Aminosäuren und Proteinstruktur

(A. Honegger) neu: Jmol/JSmol
Ein auf Jmol basierendes HTML-Dokument zeigt die dreidimensionale Struktur aller Aminosäuren und erklärt die Primär-, Sekundär-, Tertiär- und Quartärstruktur von Proteinen.

DNS-Bindende Proteine

(A. Honegger) neu: Jmol/JSmol
Interaktionen zwischen der DNS und Proteinen sind z.B. in der Replikation, in der Genexpression, sowie in der Genregulation von Bedeutung. Dieses Dokument zeigt einige wichtige Beispiel.

Vitamine

neu: Jmol/JSmol
Vitamine sind essentielle Nahrungsbestandteile, die in geringen Mengen benötigt werden. Sie können vom Organismus nicht synthetisiert werden und erfüllen eine wichtige Funktion als Koenzyme und Kofaktoren.

Strukturelle Vielfalt der Proteasen

(A. Honegger) neu: Jmol/JSmol
Proteasen sind Enzyme, welche die Hydrolyse von Peptidbindungen katalysieren - oft Verdauungsenzyme. Aehnlichkeiten und Unterschiede verschiedener Protease-Familien.

Gal4

(Eric Martz) neu: Jmol/JSmol
Gal4 ist ein Protein, das für die Regulation der Expression von Enzymen für den Galactoseabbau bei der Hefe verantwortlich ist. In diesem Tutorial wird die Struktur des Proteins, der DNA sowie der Interaktion sorgfältig und Schritt für Schritt erklärt.

Antikörper-Struktur

(A. Honegger) neu: Jmol/JSmol
Das Dokument zeigt die dreidimensionale Struktur und den Aufbau von Antikörpern.

Sulfonamide als Inhibitoren; Struktur und Funktion der Carboanhydrase

R. Deuber, A. Bärtsch, U. Leisinger mit JSmol
Verschiedene Unterrichtsmaterialien zu Sulfonamidinhibitoren und zur Carboanhydrase.

Struktur und Funktion der Carboanhydrase

(R. Deuber) mit SwissPDB-Viewer