Proteine

© Urs Leisinger 2017



Molekularium

SwissEduc Molecular Modelling


RCSB: Molecular Machinery tour und Molecule of the month


Beim Start der Seite wird eine Carboanhydrase mit dem Inhibitor Acetazolamid (AZM) dargestellt (PDB 1YDB). Viele weitere Proteine, darunter viele Proteasen und DNA-bindende Proteine, sind im Abschnitt Strukturen von Proteinen zu finden.

Strukturen von Proteinen

Protein auswählen

Inhibitoren (Namen in Klammern) sind jeweils im Kalottenmodell dargestellt.

Beim Laden:





Einfärben:

Sekundärstrukturen Helix: rot
Faltblatt: gelb
Random coil: weiss
Ketten
Hydrophilie hydrophob: gelb
hydrophil: blau
cpk Übliche Atomfärbung



Proteine / DNA darstellen:


H-Brücken ein breit aus
SS-Brücken ein nur weit
Cartoon ein aus
Backbone ein aus

Komplexbindungen bis Å


Grenzflächen

mit anderen Molekülen ein nur

Kette mit Kette





Viewer:

Jsmol 3Dmol iCn3d molmil NGL
Molmil zeigt nicht immer dasselbe Protein, da die Datenbank PDBJ teils andere ID aufweist.




Sekundärstrukturen

β-Faltblatt

Porin (OMPF-Porin aus E. coli, Proteindatenbank-Eintrag 2omf

Protein
Cartoon
Ausschnitt des β-Faltblatts
kleiner Ausschnitt

  • Wasserstoffbrücken ein aus
  • Cartoon einaus

α-Helix

Keratin (Protein-Datenbankeintrag 4ZRY)

Protein
Cartoon
Ausschnitt einer α-Helix
kleiner Ausschnitt

  • Wasserstoffbrücken ein aus
  • Cartoon einaus






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